En México, en los últimos dos meses (marzo-abril del 2020), los científicos más importantes de las instituciones de la salud, como el Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, el Instituto Mexicano del Seguro Social, el Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición y la Universidad Nacional Autónoma de México, así como de connacionales trabajando en la Universidad de Oxford, se han dedicado a estudiar las variantes del coronavirus SARS-CoV-2 en pacientes mexicanos enfermos con el proyecto “Epidemiología Genómica del SARS-CoV-2 en México”. El propósito es su caracterización genética (metagenómica) para determinar cómo afecta a los mexicanos, desde un contexto local y contribuir a nivel mundial para encontrar la solución de como detener su infección. Para ello, se han diseñado los protocolos que permiten secuenciar el genoma de este virus, con muestras desde los inicios de la enfermedad en nuestro país. En cinco días fueron capaces de realizar el primer análisis metagenómico, encontrando una asociación muy estrecha con el coronavirus de Brasil, provenientes de Lombardía (Italia). En dos meses, se han secuenciado los genomas de 32 muestras del virus SARS-CoV-2, comprobando con ello, que 15 eran de casos importación, uno de una persona que tuvo contacto en el país con un viajero y otro más, atribuido al contagio comunitario. Con lo anterior, se han identificado dos grupos o linajes del SARS-CoV-2, denominadas G y S, y se ha previsto que éste llegó a México entre los primeros quince días de marzo. El proyecto está dispuesto al análisis de 250 muestras, para obtener al menos 150 genomas completos. Con ésta y otras investigaciones a nivel mundial, se ha determinado que el genoma del SARS-CoV-2 tiene aproximadamente 30 mil nucleótidos, los bloques que conforman la estructura de su ácido nucleico. Los cambios encontrados hasta ahora, solo presentan entre 8 y 14 cambios de nucleótidos en relación al primer virus que se secuenció en Wuhan, lo que se considera como una alta conservación del genoma, con una identidad del 99.97% con la cepa original. La evolución de la filogenómica del SARS-CoV-2 puede consultarse en la página web  https://nextstrain.org/.