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U.M.S.N.H. Año 11 /Noviembre - Diciembre/ No. 66



            razones de espacio sería imposible mencionarlas        encontraban presentes en el área del brote, pero
            en este artículo, pero te describimos las principa-    que no tenían relación con este.
            les.                                                         Lo que en la actualidad se considera la he-
                  Durante este periodo se han abordado dis-        rramienta más poderosa de identificación y tipifi-
            tintas clasificaciones de las técnicas genético-mo-    cación para el diagnóstico surgida en los últimos
            leculares  de  tipificación.  Por  ejemplo,  podían    años,  ha  sido  sin  duda  alguna  la  obtención  y  el

            dividirse en dos grupos, de acuerdo con las carac-     análisis de la Secuencia de Nucleótidos del Ge-
            terísticas generales de la metodología empleada,       noma completo de las bacterias (por sus siglas en
            diferenciándose en aquellas basadas en «patrones       inglés Whole Genome Sequencing, WGS). Esto ha
            de bandeo» del ADN y las basadas en secuencias         sido posible debido al desarrollo de técnicas de
            de ADN. El término «patrones de bandeo» se re-         secuenciación masiva que permiten la obtención
            fiere a que las diferencias entre las bacterias ana-   de millones de datos sobre la secuencia de un ge-
            lizadas se establecen con base en fragmentos de        noma, tan solo en unas horas o pocos días, depen-
            ADN de distinto tamaño molecular que se pueden         diendo de la técnica de secuenciación empleada y
            visualizar mediante métodos de rutina en un la-        del tamaño del genoma analizado.

            boratorio de biología molecular. La técnica de pa-           Debido a que las técnicas de secuenciación
            trones de bandeo que ha sido considerada un es-        masiva  generan  fragmentos  pequeños  de  ADN,
            tándar de oro para la y subtipificación bacteriana,    se  requiere  de  herramientas  de  cómputo  para
            es la Electroforesis en Geles de Campo Pulsado         «ensamblar»  el  genoma  en  el  orden  correcto.
            (Pulse Field Gel Electrophoresis, PFGE), introduci-    Para que puedas darte una idea de este proceso,
            da por David C. Schwartz y Charles R. Cantor en        piensa  en  un  rompecabezas  de  un  gran  número
            1984.                                                  de piezas que quieras ensamblar para conocer la

                  Otra clasificación de las técnicas de identifi-  imágen completa. Las herramientas de cómputo
            cación genético molecular, distingue entre aque-       para el ensamble y análisis de secuencias de geno-
            llas basadas en la Reacción en Cadena de la Po-        mas bacterianos completos, son toda un área de
            limerasa  (Polymerase Chain  Reaction,  PCR)  y  las   especialización denominada Bioinformática, que
            no  basadas  en  esta  herramienta.  La  técnica  de   también se aplica para el análisis de otras molé-
            PCR fue descrita por Kary Mullis y sus colegas en      culas biológicas complejas como proteínas, carbo-
            1986. Quizá en los últimos meses has oído hablar       hidratos, lípidos y ácido ribonucleico (ARN), con
            bastante de esta técnica por su relevancia para        algunas diferencias específicas para cada caso. Es-
            el diagnóstico de COVID-19 para detectar al virus      tas herramientas incluyen el diseño de programas

            SARS-CoV-2, y debido a la gran cantidad de infor-      informáticos o software especializado.
            mación que se ha generado al respecto (no abor-
            daremos en detalle su fundamento y aplicación).              Herramientas de diagnóstico cada vez más
                  En el análisis de secuencias de ADN para la      simples
            tipificación bacteriana, se utilizaron inicialmente          Aunque  en  la  actualidad  el  diagnóstico  y
            uno o dos genes para identificar a la especie de       análisis epidemiológico mediante la comparación
            interés. Posteriormente, un equipo de científicos      de  genomas  completos  es  una  labor  compleja  y

            coordinados por Martin C. J. Maiden incorporó en       altamente especializada, cada año las herramien-
            1988 el análisis de la secuencia de siete genes, en    tas para desarrollar dicha tarea se han ido simpli-
            una técnica a la que se designó por sus siglas en      ficando  y  realizando  mediante  sitios  de  internet
            inglés como MLST (Multi Locus Sequence Typing).        que facilitan el análisis y la interpretación de los
            Por  sus  características,  esta  técnica  permitió  el   datos. Es de esperar que en un futuro muy cercano
            análisis de poblaciones de bacterias de la misma       tanto la obtención de genomas bacterianos como
            especie, distinguiendo de una manera muy preci-        su análisis, sean accesibles en costo para todo el
            sa aquellas bacterias relacionadas con brotes de       interesado y sin la necesidad de tener un gran co-
            infecciones  en  una  población  o  grupo  de  indivi-  nocimiento para el manejo de programas de com-

            duos, con las bacterias de la misma especie que se     putadora especializados.





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